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Ubuntu 16.04 LTS 安装 R 及 RStudio Server
1.R 的安装
1.1 首先添加镜像源
# Ctrl+Alt+ T 打开终端 | |
$ sudo gedit /etc/apt/sources.list | |
# 加入新镜像源 回车之后会自动跳出一个文本框,然后在相似的地方输入 | |
deb http://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu trusty/ |
加载镜像源还可以使用以下方法:
deb https://<my.favorite.cran.mirror>/bin/linux/ubuntu xenial/ | |
deb https://<my.favorite.cran.mirror>/bin/linux/ubuntu wily/ | |
deb https://<my.favorite.cran.mirror>/bin/linux/ubuntu trusty/ | |
deb https://<my.favorite.cran.mirror>/bin/linux/ubuntu precise/ | |
or in your /etc/apt/sources.list file, replacing by the actual URL of your favorite CRAN mirror. See | |
https://cran.r-project.org/mirrors.html for the list of CRAN mirrors. |
修改后保存并退出(File→quit)
1.2 运行命令下载公钥
# 下载公钥 $ sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys 51716619E084DAB9 | |
# 然后更新一下 | |
$ sudo apt-get update |
1.3 安装 R
$ sudo apt-get install r-base
然后验证是否安装成功:在终端输入 R,出现 R 的信息则安装成功。
1.4 其他
一些可用的包存储在 CRAN 的 Ubuntu 仓库中,包括:
r-cran-boot | |
r-cran-class | |
r-cran-cluster | |
r-cran-codetools | |
r-cran-foreign | |
r-cran-kernsmooth | |
r-cran-lattice | |
r-cran-mass | |
r-cran-matrix | |
r-cran-mgcv | |
r-cran-nlme | |
r-cran-nnet | |
r-cran-rpart | |
r-cran-spatial | |
r-cran-survival | |
r-cran-rodbc |
要更新以上的包,可以使用下面的命令(替换掉 foo):
$ sudo apt-get build-dep r-cran-foo
R 包的安装:
安装包 | |
install.packages() | |
更新包 | |
update.packages(lib.loc = "/usr/local/lib/R/site-library") |
2. 安装 Rstudio
2.1 安装
首先,去下载对应自己系统的安装文件: http://www.rstudio.com/products/rstudio/download/,然后执行一下步骤。
$ sudo apt-get install gdebi-core | |
$ wget https://download2.rstudio.org/rstudio-server-0.99.902-amd64.deb | |
$ sudo gdebi rstudio-server-0.99.902-amd64.deb |
2.2 启动 Rstudio server
在浏览器中输入地址和端口,如:
http://192.168.43.129:8787 | |
http://localhost:8787 |
然后会出现要求输入用户名和密码,这跟登录 Ubuntu 时候使用的用户和密码相同
登录后是这样的:
2.3 在 Rstudio server 里安装 ggplot2
安装 ggplot2 包之前需要先安装其它的依赖包:’ plyr ‘ , ‘ digest ‘ , ‘ gtable ‘ , ‘ reshape2 ‘ , ‘ scales ‘ , ‘ proto ‘ , 在 Rstudio 的命令窗口分别执行以下命令:
install.packages('plyr') | |
install.packages('digest') | |
install.packages('gtable') | |
install.packages('reshape2') | |
install.packages('scales') | |
install.packages('proto') |
然后,安装 ggplot2 包:
install.packages('ggplot2')
参考:
https://www.rstudio.com/products/rstudio/download-server/
https://cran.r-project.org/bin/linux/ubuntu/
https://bookdown.org/yihui/r-ninja/setup.html#r
更多 Ubuntu 相关信息见 Ubuntu 专题页面 http://www.linuxidc.com/topicnews.aspx?tid=2
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