RDS MySQL 表上 Metadata lock 的产生和处理

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创建、删除索引
修改表结构
表维护操作（optimize table、repair table 等）
删除表
获取表上表级写锁 (lock table tab_name write)

注：

支持事务的 InnoDB 引擎表和不支持事务的 MyISAM 引擎表，都会出现 Metadata Lock Wait 等待现象。
一旦出现 Metadata Lock Wait 等待现象，后续所有对该表的访问都会阻塞在该等待上，导致连接堆积，业务受影响。

为了在并发环境下维护表元数据的数据一致性，在表上有活动事务（显式或隐式）的时候，不可以对元数据进行写入操作。因此 MySQL 引入了 metadata lock，来保护表的元数据信息。

因此在对表进行上述操作时，如果表上有活动事务（未提交或回滚），请求写入的会话会等待在 Metadata lock wait。

当前有对表的长时间查询
显示或者隐式开启事务后未提交或回滚，比如查询完成后未提交或者回滚。
表上有失败的查询事务

show processlist 查看会话有长时间未完成的查询，使用 kill 命令终止该查询。

RDS MySQL 表上 Metadata lock 的产生和处理

查询 information_schema.innodb_trx 看到有长时间未完成的事务，使用 kill 命令终止该查询。

select concat('kill',i.trx_mysql_thread_id,';') from information_schema.innodb_trx i,
  (select 
         id, time
     from
         information_schema.processlist
     where
         time = (select 
                 max(time)
             from
                 information_schema.processlist
             where
                 state = 'Waiting for table metadata lock'
                     and substring(info, 1, 5) in ('alter' , 'optim', 'repai', 'lock', 'drop', 'creat'))) p
  where timestampdiff(second, i.trx_started, now()) > p.time
  and i.trx_mysql_thread_id  not in (connection_id(),p.id);

-- 请根据具体的情景修改查询语句 
-- 如果导致阻塞的语句的用户与当前用户不同，请使用导致阻塞的语句的用户登录来终止会话

RDS MySQL 表上 Metadata lock 的产生和处理

注：关于清理会话，请参考：RDS MySQL 如何终止会话 http://www.linuxidc.com/Linux/2016-08/134768.htm

如果上面两个检查没有发现，或者事务过多，建议使用下面的查询将相关库上的会话终止

-- RDS for MySQL 5.6

select 
    concat('kill', a.owner_thread_id, ';')
from
    information_schema.metadata_locks a
        left join
    (select 
        b.owner_thread_id
    from
        information_schema.metadata_locks b, information_schema.metadata_locks c
    where
        b.owner_thread_id = c.owner_thread_id
            and b.lock_status = 'granted'
            and c.lock_status = 'pending') d ON a.owner_thread_id = d.owner_thread_id
where
    a.lock_status = 'granted'
        and d.owner_thread_id is null;


-- RDS for MySQL 5.5

select 
    concat('kill', p1.id, ';')
from
    information_schema.processlist p1,
    (select 
        id, time
    from
        information_schema.processlist
    where
        time = (select 
                max(time)
            from
                information_schema.processlist
            where
                state = 'Waiting for table metadata lock'
                    and substring(info, 1, 5) in ('alter' , 'optim', 'repai', 'lock', 'drop', 'creat', 'trunc'))) p2
where
    p1.time >= p2.time
        and p1.command in ('Sleep' , 'Query')
        and p1.id not in (connection_id() , p2.id);

-- RDS for MySQL 5.5 语句请根据具体的 DDL 语句情况修改查询的条件；
-- 如果导致阻塞的语句的用户与当前用户不同，请使用导致阻塞的语句的用户登录来终止会话

RDS MySQL 表上 Metadata lock 的产生和处理

在业务低峰期执行上述操作，比如创建删除索引。
在到 RDS 的数据库连接建立后，设置会话变量 autocommit 为 1 或者 on，比如 set autocommit=1; 或 set autocommit=on;。

考虑使用事件来终止长时间运行的事务，比如下面的例子中会终止执行时间超过 60 分钟的事务。

create event my_long_running_trx_monitor
on schedule every 60 minute
starts '2015-09-15 11:00:00'
on completion preserve enable do
begin
  declare v_sql varchar(500);
  declare no_more_long_running_trx integer default 0; 
  declare c_tid cursor for
    select concat ('kill',trx_mysql_thread_id,';') 
    from information_schema.innodb_trx 
    where timestampdiff(minute,trx_started,now()) >= 60;
  declare continue handler for not found
    set no_more_long_running_trx=1;
 
  open c_tid;
  repeat
    fetch c_tid into v_sql;
 set @v_sql=v_sql;
 prepare stmt from @v_sql;
 execute stmt;
 deallocate prepare stmt;
  until no_more_long_running_trx end repeat;
  close c_tid;
end;